①元画像です。これを元に解説していきます。
②レイヤーを複製しました。
③ここで作業手順がわかりやすくなるようレイヤーを半分ずらしてみました。
わかりにくいかもしれませんが、「レイヤー１（上のレイヤー）」で
自動選択ツールを使って選択範囲を作成しています。
④「レイヤー１」上で作成した選択範囲を画像の中心に移動していきます。
選択範囲は2つのレイヤー上にまたがっています。
⑤左のアイコンがを見ていただければわかると思いますが、選択しているレイヤーを
「レイヤー１（上のレイヤー）」から「背景（下のレイヤー）」へと変更しました。
⑥スプレーツールで画像に色を付けてみました。選択範囲は2つのレイヤーにまたがっていますが、
色がついているのは「背景」部分にあたる左の画像（下のレイヤー）のみとなっています。